Dalam merealisasikan visi, misi, dan programnya, PSQ berpegang teguh pada sejumlah nilai dasar yang menjadi pedoman dalam menjabarkan visi, misi, dan tujuan institusi. Nilai-nilai tersebut adalah:

1.    Tauhid, bahwa inti dari segala program PSQ bertumpu pada asas tauhid, yakni untuk menyatakan komitmen terhadap keesaan Allah Swt, Tuhan semesta alam;

2.    Kemanusiaan, bahwa setiap orang harus dihargai pendapatnya sebagai manusia dan setiap manusia berpotensi melahirkan pendapat yang patut dihargai;

3. Ukhuwwah, bahwa perbedaan suku bangsa, bahasa, aliran, madzhab, dan agama bukanlah penghalang untuk menciptakan kebersamaan.